El Sector de Acuicultura y Pesca atiende a empresas de cultivo de camarón, cultivo de tilapia, pesca de atún, pesca de dorado, pesca de tiburón, laboratorios de postlarvas de camarón, molinos de alimentos balanceados para animales de acuicultura, plantas de procesamiento de productos pesqueros y proveedores de insumos.

El objetivo del Sector es apoyar y promover la producción, mejorar su productividad, incrementar sus exportaciones, diversificar sus productos, mantener su presencia en los mercados actuales e incursionar en nuevos mercados.